Ce sont les collectivités françaises d’outre-mer, Nouvelle-Calédonie et Polynésie française en tête, qui placent la France dans cette position. Elles sont en effet quasiment toutes situées dans des points chauds de la biodiversité mondiale, c’est-à-dire des régions très riches en espèces mais ayant perdu au moins 70 % de leurs habitats naturels originels (Caraïbes, Océan Indien, Polynésie-Micronésie, Nouvelle-Calédonie). De nombreuses espèces menacées sont également présentes en Guyane et dans les Terres australes et antarctiques françaises.
Pour l’UICN, dans le cadre du Grenelle de l’environnement, « il est indispensable de donner une nouvelle ambition à la protection de la biodiversité, à la hauteur des enjeux présents en France ». La dégradation des milieux naturels, la surexploitation, et l’introduction d’espèces envahissantes constituent les principales menaces pesant sur les espèces.