Dans le cadre d’une collaboration Inra-Cemagref, un projet intitulé « Effets de la gestion des bassins versants sur les transferts particulaires et dissous et sur la qualité biologique des eaux de surface en zone d’élevage » a été mené en association par neuf équipes de recherche. Il a rassemblé des spécialistes en écologie du paysage, agronomie et sciences du sol, hydrologie et écologie aquatique. Ce projet a mis en évidence le rôle de l’occupation des sols et de la structure du paysage des bassins versants sur les flux de matières particulaires, mais aussi celui des pratiques agricoles, plus particulièrement près des berges des cours d’eau. Une différence de flux particulaires entre deux petits bassins versants de Basse Normandie a été révélée par certains bio-indicateurs dont notamment la survie des jeunes stades de la truite.