Les préoccupations environnementales restent encore assez floues lors de l’élaboration des cahiers des charges. Telle a été la conclusion du programme de recherches mené par l’Inra depuis 2001 pour et sur le développement régional dans la région Rhône Alpes. En effet, ce programme a révélé la présence d’importantes difficultés quant à la définition des objectifs et des niveaux d’exécution. De plus, l’insuffisance des connaissances sur l’impact des pratiques et des innovations agricoles ne permet pas la préconisation de bonnes pratiques à destination des agriculteurs. Le décalage entre ces préoccupations environnementales et les leviers de l’action publique – règles de gestion, incitations financières, critères d’évaluation – subsiste et freine. Ce programme a donné lieu à la signature d’une convention entre l’Inra, le Conseil régional, la Draf et la Chambre régionale d’agriculture de Rhône-Alpes. Cette convention traite des problèmes liés à la région Rhône-Alpes : différenciation de la qualité des produits, coordination des acteurs et intégration des préoccupations environnementales, émergence de fonctions et de métiers autour de l’agriculture régionale.